DNA-markkerit ja geenikartoitus rypsinjalostuksessa -projekti päättyi vuonna 1996, jolloin tuloksista julkaistiin väitöskirja. Projektin aikana valmistui rypsin kytkentäkartta, johon palmitiini- ja öljyhappopitoisuuteen vaikuttavat geenit kartoitettiin. Kartta toimii hyvänä pohjana, kun kehitetään geenimerkkejä kasvinjalostuksen avuksi, esim. merkkiavusteiseen valintaan. Merkkiavusteisessa valinnassa valinnan perusteena käytetään geenimerkkiä, joka on kytkeytynyt haluttuun ominaisuuteen vaikuttavaan geeniin, eikä itse ominaisuutta. Geenimerkki voi sijaita jonkin matkan päässä geenistä tai itse geenissä, jolloin valinta on tehokkaampaa. Itse geenissä sijaitsevaa merkkiä kehitettäessä pitää ko. geeni sekvenssoida. Arabidopsikselta on sekvenssoitu useita geenejä ja tietoa on käytetty hyväksi sekvenssoitaessa vastaavia geenejä rypsiltä, esim. fad2 (fatty acid desaturation 2), joka vaikuttaa öljyhappopitoisuuteen ja fad3 (fatty acid desaturation 3), joka vaikuttaa linoleenihappopitoisuuteen. Merkkiavusteinen valinta helpottaisi myös taudinkestävien lajikkeiden jalostamista huomattavasti. Kalkkihomeenkestävyyteen kytkeytynyttä geenimerkkiä etsitään. Paitsi RAPD- ja SRAP-geenimerkkejä, etsinnässä käytetään hyväksi sekvenssitietoa muiden kasvien resistenssigeeneistä. Resistenssigeeneistä löytyy rakenteellisia samankaltaisuuksia, joiden avulla uusia mahdollisesti taudinkestävyyteen liittyviä geenejä (resistenssigeenianalogeja, RGA) voidaan eristää ja sekvenssoida.
Vastaava tutkija
Tanhuanpää Pirjo Hankkeen kesto 1996 - 2002
Asiasanat
rypsi, RAPD, öljyhappo, kalkkihome, alleelispesifinen PCR, merkkiavusteinen valinta, resistenssigeenianalogi, palmitiinihappo
Hankkeen vaihe: Päättynyt
HUOM! Tämä tutkimushankekuvaus on tuotettu Hankehaaviin Maa- ja elintarviketalouden tutkimuskeskuksen tutkimustietojärjestelmästä, jota ei enää ylläpidetä. Tarkista ajantaiset tutkimushanketiedot Luonnonvarakeskus Luken järjestelmästä.
|