MTT:ssa tehdyissä naudan, kanan ja sian koko perimät kattavissa geenikartoitushankkeissa on löytynyt useita tuotantoon, terveyteen ja hedelmällisyyteen vaikuttavia kromosomialueita. Seuraava askel vaikutusten taustalla olevien geenien tunnistamisessa on ollut löytyneiden alueiden hienokartoitus. Samalla on kehitetty menetelmiä tuotetun tiedon hyödyntämiseksi jalostuksessa. Tutkimukset ovat vaiheessa, jossa tuotetaan runsaasti tietoa mm. sekvenssimuuntelusta eri eläinlajeilla. Asianmukaiset tiedonhallintamenetelmät ovat välttämättömiä tulosten tulkinnassa ja hyödyntämisessä. Tärkeimmät sovellusalueet liittyvät sekvenssianalyyseihin ja muihin tiedon louhintamenetelmiin, geenien toiminnan tutkimiseen sekä proteiinien rakenteen ennustamiseen. Parhaillaan maailmalla kehitetään menetelmiä, joiden avulla voidaan laajasti tutkia geenien toimintaa, ilmenemistä ja vuorovaikutuksia. Hankkeessa on pyritty vahvistamaan bioinformatiikan tietotaitoa eläinjalostusalalla mm. kouluttamalla 2 asiantuntijaa (25 ov, Tampereen yliopiston täydennyskoulutuskeskus TYT), jotka voivat toimia paikallisina koordinaattoreina, muiden tutkijoiden kouluttajina ja yhteyshenkilöinä. Lisäksi 6 tutkijaa on suorittanut bioinformatiikan verkkokurssit (TYT, 4 ov). Osa tutkijoista on perehtynyt myös DNA-mikrosiruteknologiaan käytännön kursseilla ja tutkijavierailuilla. Genomiikkalaboratorioon palkattiin täysipäiväinen bioinformaatikko. Hanke on huomattavasti vahvistanut MTT bioinformatiikan osaamista ja luonut tarvittavat valmiudet funktionaalisen genomiikan tutkimuksiin.
Vastaava tutkija
Vilkki Johanna Hankkeen kesto 2002 - 2005
Asiasanat
molekyyligenetiikka, geenikartoitus, DNA, kotieläinjalostus
Hankkeen vaihe: Päättynyt
HUOM! Tämä tutkimushankekuvaus on tuotettu Hankehaaviin Maa- ja elintarviketalouden tutkimuskeskuksen tutkimustietojärjestelmästä, jota ei enää ylläpidetä. Tarkista ajantaiset tutkimushanketiedot Luonnonvarakeskus Luken järjestelmästä.
|