|
Clavibacter michiganensis alalaji sepedonicus (Cms) -bakteerin aiheuttama perunan vaalea rengasmätä on karanteenilakien alainen kasvitauti. Tautia pidetään yhtenä vakavimmista perunan taudeista maailmanlaajuisesti, ja se aiheuttaa mm. Suomessa merkittäviä taloudellisia menetyksiä. Kaikki tunnetut viljellyn perunan (Solanum tuberosum) lajikkeet ovat taudille alttiita, mutta Solanum acaule –villiperunalajista on löydetty rengasmädälle resistenttejä genotyyppejä. Rengasmätäresistenssi on lämpötilaan kytkeytynyt ominaisuus, joten resistenssi murtuu viileissä kasvuoloissa. Projektimme tavoitteena on selvittää S. acaule -lajin ja Cms:n välisiä molekyylitason vuorovaikutuksia, ja tunnistaa eristyisesti S. acaule -lajin resistenssiin liittyvä signalointireitti, sekä tutkia geenien säätelyä ja toimintaa eri lämpötiloissa. Tavoitteemme on varmistaa, että resistenssi on kytkeytynyt löytämäämme hypersensitiiviseen (HR) puolustusreaktioon. Geenien säätelyä tutkitaan käyttämällä yhteistyössä Scottish Crop Research Instituten kanssa perunan puolustusgeenit sisältäviä DNA-mikrosiruja, ja näin tunnistettujen puolustusgeenien toimintaa tutkitaan RNA-interferenssin avulla. Tavoitteemme on myös tunnistaa bakteerin geenejä, joiden toiminta on tarpeen puolustusvasteen synnylle ja toisaalta bakteerin infektiokyvylle.
Vastaava tutkija
Rokka Veli-Matti Hankkeen kesto 2004 - 2008
Asiasanat
mikrosiru, immuniteetti, peruna, bakteeri, rengasmätä
Hankkeen vaihe: Päättynyt
HUOM! Tämä tutkimushankekuvaus on tuotettu Hankehaaviin Maa- ja elintarviketalouden tutkimuskeskuksen tutkimustietojärjestelmästä, jota ei enää ylläpidetä. Tarkista ajantaiset tutkimushanketiedot Luonnonvarakeskus Luken järjestelmästä.
|
