Hankkeen yleisenä päämääränä on selvittää valinnan merkitystä adaptiivisen muuntelun ylläpidossa. Erityisen keskeistä on suorittaa ekologisen genomiikan tutkimusta, joka kytkee toiminnallisesti merkittävien lokusten sisältämän geneettisen muuntelun vaikuttaviin ympäristötekijöihin. Tutkimuksen kohteena on kaksi lajia, punalevä Furcellaria lumbricalis, jota esiintyy suolapitoisuudeltaan vaihtelevissa ympäristöissä, ja siemenkasveihin kuuluva vesikasvi Elodea canadensis, joka on agressiivinen tulokaslaji tutkimusalueella. Hankkeen erityiset päämäärät ovat seuraavat: 1) Kohdepopulaatioiden populaatiogeneettinen analyysi neutraalien geneettisten markkereiden avulla. 2) Stressireaktioihin vaikuttavien geenien tunnistaminen. 3) Stressireaktioihin vaikuttavien geenien populaatiogeneettinen analysointi. 4) Neutraalien ja adaptiivisten genomin alueiden evoluution tutkiminen ja vertailu. 5) Fenotyyppisen joustavuuden ja samanaikaisen evoluution suhteellisen merkityksen testaaminen muuttuviin ympäristöoloihin joutuvilla kasveilla ja uusiin ympäristöihin leviävillä tulokaslajeilla. 6) Nopeampien ja kustannustehokkaampien menetelmien kehittäminen adaptiivisten geenien tunnistamista ja analysoimista varten. 7) Populaatioiden seurannassa käytettävien ennustavien menetelmien kehittäminen. Populaatiogeneettiset perusominaisuudet kartoitetaan neutraalien geneettisten mikrosatelliittimarkkerien avulla, minkä jälkeen etsitään, tunnistetaan ja tutkitaan stressireaktioihin vaikuttavia geenejä cDNA-AFLP –menetelmän avulla. Kyseinen menetelmä on tehokas vaihtoehto suoritettaessa genomin kattavaa geeniekspression profilointia liittyen erilaisiin biologisiin ominaisuuksiin ja verrattaessa muuntelua geeniekspressiossa yksilöiden ja ryhmien välillä.
Vastaava tutkija
Korpelainen Helena, Helsingin yliopisto, Soveltavan biologian laitos Hankkeen kesto 2007 - 2010
Asiasanat
molekyyliekologia, populaatiogenetiikka, ympäristön aiheuttama stressi, geeniekspressio, sopeutuminen, vesikasvit
Hankkeen vaihe: päättynyt
HUOM! Tämä tutkimushankekuvaus on tuotettu Hankehaaviin Helsingin yliopiston TUHTI-tutkimustietojärjestelmästä, jota ei enää ylläpidetä. Tarkista ajantaiset tutkimushanketiedot Helsingin yliopiston TUHAT-järjestelmästä.
|