|
Perunan tyvi- ja märkämätätauti, jota aiheuttaa Erwinia carotovora-bakteerin alalajit atroseptica ja carotovora sekä myös Euroopassa nopeasti leviävä E. chrysanthemi, on kotimaisen siementuotannon pahimpia laatuongelmia. Se heikentää luottamusta kotimaisen siemenen laatuun, lisää paineita ulkomaisen siemenen tuontiin ja haittaa orastavia vientiponnisteluja. Lisäksi märkämätä pilaa pahoina vuosina satoja tonneja prosessoitavaksi tarkoitettua ruokateollisuusperunaa. Tämän tutkimuksen tavoitteena on luoda riskinarviointimenetelmä, jonka avulla bakteerilajin, bakteerien määrän ja ominaisuuksien perusteella voidaan todeta piilevän Erwinia-infektion olemassaolo ja arvioida perunaerän pilaantumisherkkyys. Tutkimuksen aluksi selvitetään, mitkä Erwinia-lajit ja alalajit aiheuttavat tyvi- ja märkämätää Suomessa. Perunan tuotantoympäristöstä ja muualta luonnosta kerätään Erwinia-kantoja, joiden laji, alalaji, genotyyppi ja ominaisuudet määritetään. Bakteerien genomista tai muista ominaisuuksi st a pyritään löytämään tekijä, jonka avulla voidaan ennustaa bakteerin aggressiivisuus, jotta bakteerin osoittamisen yhteydessä voidaan myös päätellä taudin puhkeamisriski. Bakteerin osoittamiseksi kehitetään PCR-pohjaisia diagnostisia tunnistusmenetelmiä käyttäen hyväksi MTT:n Kasvintuotannon tutkimuksen jo tuottamia molekyylibiologisia tyvi- ja märkämädän osoittamismenetelmiä. Jo olemassa olevia ja projektin aikana kehitettäviä uusia menetelmiä hyödynnetään suunniteltaessa kaupallisia kittejä tai analyysipalveluita. Menetelmien avulla määritetään käytännön siemenerien saastunnan ja pellolla ilmenevän taudin määrän välinen yhteys ja sertifioinnin raja-arvot. Tutkimuksen tuottamat analyysipalvelut siirretään Kasvintarkastuksen ja muun peruna-alan käyttöön niiden valmistuttua. Hankkeen johtamisesta vastaa Helsingin yliopiston soveltavan biologian laitos yhdessä MTT:n Kasvintuotannon tutkimuksen (Kasvinsuojelu) ja Finnzymes Oy:n kanssa. MTT:n Pohjois-Pohjanmaan tutkimusasema, KTTK:n S ieme ntarkastusosasto, Perunatutkimuslaitos, Suomen Siemenperunakeskus Oy, Pohjoisen kantaperuna Oy ja Ravintoraisio Oy Ruokaperuna osallistuvat hankkeen toteuttamiseen.
Tulokset
Hanke aloitettu kesäkuussa 2004
Vastaava tutkija
Pirhonen Minna, Helsingin yliopisto, Soveltavan biologian laitos Yhteistyötahot
MTT, Kasvinsuojelu
Hankkeen kesto 2004 - 2007
Asiasanat
peruna, biotekniikka, diagnostiikka, PCR, tyvimätä, märkämätä
Hankkeen vaihe: päättynyt
HUOM! Tämä tutkimushankekuvaus on tuotettu Hankehaaviin Helsingin yliopiston TUHTI-tutkimustietojärjestelmästä, jota ei enää ylläpidetä. Tarkista ajantaiset tutkimushanketiedot Helsingin yliopiston TUHAT-järjestelmästä.
|
HELSINGIN YLIOPISTO