|
Elinvoimaisten kalakantojen säilyttäminen edellyttää niiden geneettisten resurssien säilyttämistä. Geneettinen tutkimus tarjoaa suoraa tietoa geneettisten resurssien tilasta. Suurin osa kalageneettisestä tutkimuksesta tehdään tiiviissä yhteistyössä muiden tutkimushankkeiden kanssa, osana kotimaisia tai kansainvälisiä yhteistyöprojekteja tai ulkoisesta tilauksesta.
Hanke on jatkuva. Tavoitteet Hankkeessa tutkitaan perinnöllisen monimuotoisuuden esiintymistä taloudellisesti merkittävillä kalalajeilla, sekä tämän tiedon hyödyntämistä monimuotoisuuden säilyttämisessä, kalakantojen ja yksilöiden tunnistamisessa, kalastuksensäätelyn suunnittelussa ja kalanviljelyssä. Hankkeessa tehdään populaatiogeneettistä tutkimusta kalakantojen perinnöllisestä rakenteesta, niiden välisistä perinnöllisistä eroista, perinnöllisen muuntelun määrästä ja evolutiivisesta historiasta. DNA:n mikrosatellittimarkkereiden muuntelua käytetään myös hyväksi alkuperäkantojen osuuksien määrittämiseksi Itämeren lohisaaliista, sekä saaliskalojen yksilöalkuperän identifioinnissa istutusten vaikutuksia arvioitaessa. DNA-markkereihin perustuvaa analyysiä käytetään myös emokalastojen yksilöiden välisen sukulaisuuden laskemiseen. Tulokset Vuonna 2013 ja saatiin päätökseen Suomenlahden alueen taimenkantakartoitus (EU Interreg HEALFISH 2010-2013). Lisäksi analysoitiin EU-näytteenotto-ohjelman pysyvänä seurantana lohisaaliit kolmelta merialueelta (1300 kalaa). Analyysipalveluna voidaan nykyään tarjota 15 geenilokuksen valtakunnallinen DNA-mikrosatelliitti standardi-setti lohi-, taimen-, siika-, muikku, kirjolohi, nieriä- , harjus- ja kuhatutkimuksia varten. Vaikuttavuus Tietoa kalakantojen geneettisistä rakenteista hyödyntävät kaikki kalakantojen käyttöä ja hoitoa suunnittelevat tahot, ELY-keskukset, kalojen istuttajat ja viljelijät. Sukulaisuusanalyysiä voidaan hyödyntää kalanviljelyssä sukulaisuuden hallintaan ja hedelmöityssuunnitelmien tekemiseen. Saaliiden kantaosuusanalyysi kertoo, mitä kalakantoja eri merialueilla kalastetaan ja missä määrin. Erityisesti on tärkeää arvioida luonnonvaraisesti syntyneiden lohien osuus saalissa, eri aikaan ja eri osissa Itämerta. Tutkimus mahdollistaa myös kantojen välisten erojen tutkimuksen merialueella, ilman varsinaista ulkoista merkkiä. Lohisaaliiden kantaosuusanalyysi on osa vuosittaista EU:n näytteenotto-ohjelmaa. Vastaava tutkija Koljonen Marja-Liisa, Riista- ja kalatalouden tutkimuslaitos
Yhteystiedot
Muut henkilöt Saura Ari Yhteistyötahot Rahoittajat: EU:n Data Collection Programme, EU:n Interreg Central Baltic Programme (2010-2012), EKTR, UM, Ely-keskukset , Kotimainen yhteistyö: HY Maataloustieteiden laitos, ELY-keskukset, MTT. , Kansainvälinen yhteistyö: ICES:n työryhmät WGBAST, WGAGFM ja SIMWG. Estonian University of Life Sciences, Fiskeriverket, Alaska Fisheries Science Center. Julkaisut Uusimmat julkaisut:
Kallio-Nyberg, I., Salminen, M., Pakarinen, T. and Koljonen, M-L. 2013. Cost-benefit analysis of Atlantic salmon smolt releases in relation to life-history variation. Fisheries Research 145:6-14.
Koljonen, M-L., Janatuinen, A., Saura, A. and Koskiniemi, J. 2013. Genetic structure of Finnish and Russian brown trout populations in the Gulf of Finland area. Working papers of the Finnish Game and Fisheries Institute 100 pp.
Swatdipong, A., Vasemägi, A., Niva, T., Koljonen, M.-L, and Primmer, C. R. 2013. Genetic mixed-stock analysis of lake-run brown trout Salmo trutta fishery catches in the Inari Basin, northern Finland: implications for conservation and management. Journal of Fish Biology 83:598-617.
Hario, M., Koljonen, M-L, Rintala, J. 2012. Kin structure and choice of brood care in a Common Eider (Somateria m. mollissima) population. Journal of Ornithology 153: 963-973.
Vuori, K., Kiljunen, M., Kanerva, M., Koljonen, M-L., Nikinmaa, M. 2012. Stock-specific variation in food webs (stable isotopes) and environmental stress (enzyme markers) of Atlantic salmon during the feeding migration in the Baltic Sea. Journal of Fish Biology in press.
Swatdipong, A., Vasemägi, A., Niva T., Koljonen, M-L, and Primmer, C. P. Genetic mixed-stock analysis of lake-run brown trout fisheries catches in the Inari basin, northern Finland: implications for conservation and management. Manuscript
****************
1. Säisä M., Rönn, J., Aho, T., Björklund, M., Pasanen, P., Koljonen, M-L. 2008. Genetic differentiation among European whitefish ecotypes based on microsatellite data. Hereditas, in press. Doi:10.111/j.2008.0018-0661.02050.x
2. Palm, S., Dannewitz, J., Järvi, T., Koljonen, M-L., Prestegaard, T., Olsén, H. 2008. No indications of Atlantic salmon (Salmo salar) shoaling with kin in the Baltic Sea (Salmo salar, L.). Can. J. Fish. Aquat. Sci. 65: 1738-1748.
3. Kallio-Nyberg, I., Saloniemi, I., Koljonen, M-L. 2007. Effects of parental and smolt traits on the marine survival of released Atlantic salmon (Salmo salar). Aquaculture 272: 254-266.
4. Koljonen, M-L. King, T. L. and Nielsen, E. E. 2007. Genetic identification of individuals and populations. In: The Atlantic salmon: genetics, conservation, and management (eds. E. Verspoor, L. Stradmeyer and J. Nielsen). Blackwell Publishing. pp. 271-298.
5. Cross, T.F., McGinnity, P. Coughlan, J., Dillane, E., Ferguson, A., Koljonen, M.-L., N. Milner, O?Reilly, P., and Vasemägi, A. 2007. Stocking and ranching. In: The Atlantic salmon: genetics, conservation, and management (eds. E. Verspoor, L. Stradmeyer and J. Nielsen). Blackwell Publishing pp. 325-356.
6. Hindar, K., García de Leániz, C., Koljonen, M.-L., Tufto, J., Youngson, A. F. 2007. Fisheries Exploitation. In: The Atlantic salmon: genetics, conservation, and management (eds. E. Verspoor, L. Stradmeyer and J. Nielsen). Blackwell Publishing. pp. 299-324.
7. Olsson J, Aho T, Florin A-B, Vainikka A, Bekkevold D, Dannewitz J, Hindar K, Koljonen M-L, Laikre L, Magnussen E, Pálsson S. 2007. Genetic research on commercially exploited fish species in Nordic countries. TemaNord 2007: 542.
8. Koljonen, M-L. 2006. Annual changes in the proportions of wild and hatchery Atlantic salmon (Salmo salar) caught in the Baltic Sea. ICES Journal of Marine Science 63: 1274-1285.
9. Jounela, P., Suuronen, P., Millar, R. B., and Koljonen, M.-L. 2006. Interactions between seal stocks, salmon stocks and harvest controls of the salmon fishery in the Gulf of Bothnia. ICES Journal of Marine Science 63: 936-945.
10. Koljonen, M.-L., Pella, J.J., Masuda, M. 2005. Classical individual assignments versus mixture modeling to estimate stock proportions in Atlantic salmon (Salmo salar) catches from DNA microsatellite data. Can. J. Fish. Aquat. Sci. 62, 2143-2158.
11. Säisä, M., Koljonen, M.-L., Gross, R., Nilsson, J., Tähtinen, J., Koskiniemi, J., Vasemagi, A. 2005. Population genetic structure and postglacial colonization of Atlantic salmon in the Baltic Sea area based on microsatellite DNA variation. Can. J. Fish. Aquat. Sci. 62, 1887-1904.
12. Verspoor, E., Beardmore J.A., Consuegra, S., Garía de Leániz, C., Hindar, K., Jordan, W.C., Koljonen, M-L., Mahkrov, A.A., Paaver, T., Sánchez, J.A., Skaala, O., Titov, S., and Cross, T.F. 2005. Population Structure in the Atlantic salmon: insights from 40 years of research into genetic protein variation. Journal of Fish Biology. 67: 3-54.
13. Vasemägi, A., Gross, R., Paaver, T., Koljonen, M-L. and Nilsson, J. 2005. Extensive immigration from compensatory hatchery releases into wild Atlantic salmon population in the Baltic Sea: spatio-temporal analysis over 18 years. Heredity 95: 76-83.
14. Vasemägi, A., Gross, R., Paaver, T., Koljonen, M.-L., Säisä, M. and Nilsson, J. 2005. Analysis of gene associated tandem repeat markers in Atlantic salmon (Salmo salar L.) populations: implications for restoration and conservation in the Baltic Sea. Conservation Genetics 6: 385-397.
15. Koljonen, M.-L. 2004. Itämeren lohen historia ja perinnöllinen rakenne. Teoksessa: M. Walls, M. & M. Rönkä (toim.), Veden varassa - Suomen vesiluonnon monimuotoisuus, 88 - 95 s. Edita Publishing Oy. Helsinki.
16. Koljonen, M.-L. 2004. Geneettisen monimuotoisuuden säilyttäminen kalakannoissa Teoksessa: M. Walls, M. & M. Rönkä (toim.), Veden varassa; Suomen vesiluonnon monimuotoisuus, 208 - 213 s. Edita Publishing Oy. Helsinki.
17. Koljonen, M.-L. 2004. Changes in stock composition of annual Atlantic salmon catches in the Baltic Sea on basis of DNA-microsatellite data and Bayesian estimation. ICES CM 2004/Stock Identification Methods/EE:08, 21 pp.
18. Michielsens, C. Mäntyniemi, S., Koljonen M.-L. 2004. The use of genetic stock identification results for the assessment of wild Baltic salmon stocks. ICES CM 2004/EE:03, 15 pp.
19. Säisä, M., Koljonen, M.-L. and Tähtinen, J. 2003. Genetic changes in Atlantic salmon stocks since historical times and the effective population sizes of the long-term captive breeding programmes. Conservation Genetics 4, 613- 627.
20. Koljonen, M.-L., Tähtinen, J., Säisä, M. and Koskiniemi, J. 2002. Maintenance of genetic diversity of Atlantic salmon (Salmo salar) by captive breeding programmes and the geographic distribution of microsatellite.
21. Koljonen, M.-L., Jansson, H., Paaver, T., Vasin, O. and Koskiniemi, J. 1999. Phylogeographic lineages and differentiation pattern of Atlantic salmon in the Baltic Sea with management implications. Can. J. Fish. Aquat. Sci. 56: 1766-1780.
Hankkeen kesto 1997 - Hankkeen vaihe: päättynyt
|
