Valinta on kestävä tapa kehittää eläintuotantoa. Valinnan teho on suoraan riippuvaista geneettisen vaihtelun määrästä. Erilaiset tekijät voivat kaventaa vaihtelun määrää. Tärkeimmät niistä ovat populaation pieni koko ja vain muutaman perheen ja sukulinjan suosiminen valinnassa. Seurauksena on populaation yksilöiden sukulaistuminen ja sattuman aiheuttamien poikkeamien suureneminen ja pitkän päälle sukusiitosriski. Pahimmillaan tämä voi johtaa letaalialleelien rikastumiseen ja niistä johtuvien tautien ilmestymiseen populaatioon. Genomianalyysien avulla voidaan tutkia minkälaisia muutoksia on tapahtunut genomin eri osissa intensiivisen valinnan tai jälkeläisiä saaneiden yksilöiden määrän vähyyden takia. Vaihtelun hallinnassa voidaan keskittyä esille tulleisiin alueisiin. Geneettisen vaihtelun hallintaan on kehitetty kvantitatiivisia sukupuutietoihin perustuvia välineitä. Niitä ja valintaa voidaan soveltaa myös perheen sisäisen vaihtelun kontrollointiin. Uudet menetelmät yhdessä laskennallisen genetiikan välineiden kanssa tarjoavat ensimmäistä kertaa mahdollisuuden koko genomin kattavaan geneettiseen analyysiin. Näiden menetelmien tuottamaa tietoa voidaan hyödyntää säilytysohjelmissa ja eläinjalostuksessa. Uuden tiedon avulla voidaan tunnistaa esimerkiksi ainutlaatuisia geenivaroja tai parantaa eläinten terveyttä. Hankkeessa sovelletaan uusia genomi- ja laskentamenetelmiä kolmesta näkövinkkelistä: - Eri nautarotujen genomin rakenteen määrittäminen säilytys- ja jalostusohjelmien tueksi. - Geneettisen vaihtelun ylläpito säilytys- ja jalostusohjelmissa. - Jalostusohjelman geneettisen monimuotoisuuden hyödyntäminen tuottamaan tasalaatuisia eläimiä ruoka-arvoketjun käyttöön. Hankkeen eri osat tukevat toisiaan ja ne käyttävät samoja uusia genomiikan ja laskennallisen genetiikan menetelmiä. Vaikutus yhteiskuntaan tapahtuu parantuneiden säilytys- ja jalostusohjelmien välityksellä. Vaikutuksen mittareina ovat geneettinen edistyminen jalostusohjelmissa, sukulaistumisen hallinta, sukusiitoksen välttäminen, parantuneen eläinaineksen toimittaminen kasvattajille, ja kuluttajatyytyväisyys. Nämä ovat samalla etuja MTT:n yhteistyökumppaneille. Hanke on tieteellisesti innovatiivinen ja hyödyntää maailmanlaajuisesti ainutlaatuisia tietolähteitä. Hanke edistää myös kansallista ja kansainvälistä verkostoitumista ja syventää MTT:n osaamista.
Vastaava tutkija
Kause Antti Hankkeen kesto 2009 - 2012
Asiasanat
valinta, vaihtelun hallinta, eläinjalostus, genomivalinta, SNP-siru, genomiikka
Hankkeen vaihe: päättynyt
HUOM! Tämä tutkimushankekuvaus on tuotettu Hankehaaviin Maa- ja elintarviketalouden tutkimuskeskuksen tutkimustietojärjestelmästä, jota ei enää ylläpidetä. Tarkista ajantaiset tutkimushanketiedot Luonnonvarakeskus Luken järjestelmästä.
|