Kansainvälisessä Interbull-sonnijalostusarvostelussa lypsyrotuisille sonneille lasketaan jalostusarvojen ennusteet useille eri ominaisuuksille. Tavoitteena on tuottaa mahdollisimman luotettavia ennusteita sonnien kansainvälisestä jalostusarvosta. Maat voivat määritellä ja mallintaa ominaisuuksia, esimerkiksi valkuaistuotosta, varsin eri tavoin. Siksi eri maista tulevia tietoja pidetään eri ominaisuuksina ja Interbull-jalostusarvostelussa käytetään monenominaisuuden mallia. Kullekin sonnille lasketaan jalostusarvon ennuste jokaisessa maassa, joka on mukana kansainvälisessä Interbull-arvostelussa. Jalostusarvostelussa käytettävä varianssikovarianssimatriisi (VCV) kuvaa vaihtelua niin maiden sisällä kuin maiden välillä. VCV-matriisin koko määräytyy osallistujamaiden mukaan. Matriisi estimoidaan joka kerta kun jalostusarvosteluun liittyy uusia maita tai kun ominaisuuden määritelmä tai mallinnus muuttuu jossakin maassa. Käytännössä VCV-matriisin estimointi on hankalaa, koska osallistujamaita on paljon ja joidenkin maiden väliltä puuttuu geneettinen yhteys. Toisin sanoen sonneilla ei ole tyttäriä kaikissa maissa. VCV-matriisi on liian suuri kokonaisena estimoitavaksi. VCV-matriisin estimointi osa kerrallaan ja osien liittäminen kokonaiseksi matriisiksi johtaa helposti singulaariseen tai ei-positiivis-definiittiseen matriisiin. Mäntysaari (2004) osoitti, että kansainvälinen jalostusarvostelu ja varianssikomponenttien estimointi voidaan analysoida satunnaisregressiomallilla. Tämä mahdollistaa ominaisuuksien välisten lineaaristen yhteyksien kuvaamisen ominaisarvojen ja ominaisvektorien avulla. Menetelmän avulla matriisien dimensioita voidaan pienentää poistamalla vaikutukseltaan mitättömät ominaisarvot ja -vektorit ja päästä näin eroon matriisien singulaarisuusongelmasta. Tämä puolestaan johtaa tarkempiin varianssikomponenttien arvioihin ja tehostaa laskentaa. Tutkimushankkeessa vertaillaan kolmea erilaista menetelmää keskenään: ns. bottom-up pääkomponenttimenetelmää, ns. suoraa pääkomponenttimenetelmää ja faktorianalyysimenetelmää. Kaikki edellä mainitut menetelmät mahdollistavat dimensioiltaan pienempien mallien käyttämisen.
Vastaava tutkija
Lidauer Martin Hankkeen kesto 2008 - 2010
Asiasanat
kansainvälinen jalostusarvostelu, varianssikomponenttien estimointi, satunnaisregressiomalli, reduced rank (vähennetty asteluku), lypsykarja, Interbull
Hankkeen vaihe: Päättynyt
HUOM! Tämä tutkimushankekuvaus on tuotettu Hankehaaviin Maa- ja elintarviketalouden tutkimuskeskuksen tutkimustietojärjestelmästä, jota ei enää ylläpidetä. Tarkista ajantaiset tutkimushanketiedot Luonnonvarakeskus Luken järjestelmästä.
|