Eläinjalostus ja eläingenetiikan tutkimus perustuvat suurien havaintomäärien käyttöön. Yleensä kokeet, joissa ympäristötekijöitä voidaan kontrolloida perinnöllisen osuuden arvioimiseksi, eivät ole mahdollisia taloudellisista syistä. Kaiken informaation saaminen kenttäaineistosta merkitsee usein monimutkaisten tilastollisten mallien käyttöä sekä suuria eläin- ja tuotostietomääriä. Käytännössä tarvitaan parhaita numeerisia ja tilastollisia menetelmiä sekä tehokkaiden tietokoneiden käyttöä. Projektin aikana tutkittiin seuraavia asioita: arvosteluvarmuuden laskenta suurille aineistoille, epälineaariset mallit jalostusarvosteluissa, jalostusarvostelujen laskenta tiloilla sekä paranneltiin nykyisin yleisesti käytössä olevaa jalostusarvojen laskentaohjelmaa MiX99:ää. Kaksi viimeistä aihetta liittyivät suoraan käytännön jalostusarvostelujen kehittelyyn: lypsykarjan jalostusarvostelumalli Iso-Britanniassa ja turkiseläinten jalostusarvostelu Suomessa. Tarvittavat muutokset tehtiin MiX99-ohjelmistoon. Seuraavassa hiukan tarkemmin projektin merkittävimpiä osia. Jalostusarvostelujen luotettavuutta kuvaava arvosteluvarmuus on laskennallisesti vaativampi kuin varsinainen jalostusarvostelu. Käytännössä vain approksimatiiviset menetelmät ovat toteutettavissa suurilla aineistoilla, kuten lypsykarjalla. Tässä tutkimuksessa päädyimme menetelmään, joka hyödyntää sukulaisinformaatiota lähisukulaisapproksimaatiolla. Vertasimme menetelmää toiseen approksimatiiviseen menetelmään ja menetelmät antoivat samankaltaisia tuloksia. Molemmat menetelmät ohjelmoitiin MiX99-ohjelmistoon, jota käytetään käytännön jalostusarvojen laskennassa Suomessa ja muuallakin. Jalostusohjelmissa on yhä useammin huomioitava epälineaarisia ominaisuuksia. Tyypillinen epälineaarinen ominaisuus on kasvu, jonka mallintamiseen on luonnollista käyttää Gompertzin kasvukäyrää. Tämän tutkimusosion tavoitteena oli kartoittaa varianssikomponenttien ja jalostusarvojen arviointimenetelmiä epälineaarisilla sekamalleilla ja toteuttaa paras menetelmä käytännön jalostusarvostelusovellukseen. Arvioinnin pohjalta ohjelmoitiin MiX99-ohjelmistoon Gompertzin malli, jossa käytetään myös perusvarianssikomponenttien arviointimenetelmän (REML) ohjelmistoa. Estimointimenettelyn toimivuus havaittiin hyväksi pienellä simulaatiolla, jossa mallinnettiin sian kasvua.
Vastaava tutkija
Strandén Ismo Hankkeen kesto 2000 - 2004
Asiasanat
tilastollinen malli, lineaarinen malli, varianssikomponentit, periytyvyysaste, jalostusarvo, tietokonelaskenta
Hankkeen vaihe: Päättynyt
HUOM! Tämä tutkimushankekuvaus on tuotettu Hankehaaviin Maa- ja elintarviketalouden tutkimuskeskuksen tutkimustietojärjestelmästä, jota ei enää ylläpidetä. Tarkista ajantaiset tutkimushanketiedot Luonnonvarakeskus Luken järjestelmästä.
|