Projektissa määritetään kahden taloudellisesti tärkeän, perunaa ja muita kasveja mädättävän Pectobacterium carotovorum –bakteerin genominen sekvenssi ja tuotetaan sekvenssitiedon perusteella bakteereille mikrosiru. Genomisen sekvenssin ja sen perusteella tehdyn mikrosirun avulla halutaan vertailla näiden bakteereiden genomien ja populaatioiden rakennetta sekä tutkia systeemitasolla geeniekspressiota bakteerin infektoidessa isännän solukoita tärkeimpien virulenssitekijöiden tunnistamiseksi sekä virulenssimekanismien selvittämiseksi. Projektissa tehtyjen mikrosirujen avulla halutaan löytää myös laji- ja kantaspesifisiä koettimia, joita voidaan hyödyntää real time- ja mikrosirudiagnostiikassa. Projektissa saatavat tulokset antaisivat uutta tietoa näiden maailmanlaajuisesti tärkeiden kasveja mädättävien bakteereiden ekologiasta ja infektiobiologiasta, hyödyttävät modernien diagnostisten metodien kehittämistä taudin ennaltaehkäisyyn sekä mahdollistavat taudille vastustuskykyisempien lajikkeiden kehittämisen. Projekti tehdään yhteistyössä Soveltavan biologian laitoksen, Bio- ja ympäristötieteiden laitoksen ja Biotekniikan instituutin välillä, ja sitä rahoittaa yliopisto.
Vastaava tutkija
Pirhonen Minna, Helsingin yliopisto, Soveltavan biologian laitos Hankkeen kesto 2008 - 2010
Asiasanat
kasvitaudit, mädättäjät, perunanmärkämätä, genominen sekvenssi, mikrosirut
Hankkeen vaihe: päättynyt
HUOM! Tämä tutkimushankekuvaus on tuotettu Hankehaaviin Helsingin yliopiston TUHTI-tutkimustietojärjestelmästä, jota ei enää ylläpidetä. Tarkista ajantaiset tutkimushanketiedot Helsingin yliopiston TUHAT-järjestelmästä.
|