Kasvien systeemisen virusinfektion vaiheet ovat replikaatio infektoituneessa solussa, viruksen siirtyminen soluja yhdistävien kanavien kautta viereisiin soluihin ja johtosolukon kautta kasvin muihin osiin. Infektion eri vaiheet vaativat toteutuakseen monenlaisia virusproteiinien ja kasviproteiinien vuorovaikutuksia. Potyvirukset muodostavat laajimman kasvivirusperheen (>150 virusta), ja ne infektoivat lukuisia eri tyyppisiä kasveja. Perunavirus A:n (PVA; Potyvirus) partikkelit muodostuvat virus RNA:sta, genomiin kovalenttisesti sitoutuneesta proteiinista (VPg) ja noin 2000:sta kuoriproteiinimolekyylistä (CP). Sekä VPg että CP osallistuvat useisiin toimintoihin. Ne molemmat ovat oleellisia viruksen liikkumiselle ja lisäksi VPg:tä tarvitaan virus RNA:n monistamisessa. Tutkimussuunnitelmassa tavoitteena on perehtyä molekyylitasolla näihin toimintoihin. Olemassa olevan todistusaineiston pohjalta näyttää siltä, että potyvirukset liikkuvat kasveissa partikkeleina. Tästä syystä tavoitteena mm e on tutkia partikkelinmuodostuksen säätelyä, partikkelien rakennetta ja viruspartikkelissa esiintyvien VPg:n ja CP:n vuorovaikutuksia muiden virus- ja isäntäproteiinien kanssa. Sekä VPg että CP fosforyloidaan isäntäkasvin kinaasien toimesta. Tutkimme näiden proteiinisynteesin jälkeen tehtävien modifikaatioiden merkitystä kyseisten proteiinien toiminnan säätelyssä infektion aikana ja toiminnan ymmärtämiseksi pyrimme selvittämään VPg:n ja CP:n rakenteen. Käytämme useita edistyneitä tekniikoita ja olemme yhteistyössä niihin perehtyneiden tutkijoiden kanssa.
Vastaava tutkija
Mäkinen Kristiina, Helsingin yliopisto, Soveltavan kemian ja mikrobiologian laitos, Kemian ja biokemia Yhteistyötahot
SBL, Scottish Crop Research Institute
Hankkeen kesto 2006 -
Asiasanat
potyvirukset, partikkeli, kuoriproteiini, genomiin kiinnittyvä proteiini VPg, translaation jälkeiset modifikaatiot, vuorovaikutukset
Hankkeen vaihe: päättynyt
HUOM! Tämä tutkimushankekuvaus on tuotettu Hankehaaviin Helsingin yliopiston TUHTI-tutkimustietojärjestelmästä, jota ei enää ylläpidetä. Tarkista ajantaiset tutkimushanketiedot Helsingin yliopiston TUHAT-järjestelmästä.
|