Metabolomiikka tarkoittaa pienikokoisten molekyylien (metaboliittien) pitoisuusmittausta eliön soluissa tunnetuissa tietyissä oloissa. Koska soluissa esiintyy suuri joukko erityyppisiä metaboliitteja, metabolomiikan suuria haasteita ovat näytteiden esikäsittely, sekä metaboliittien tunnistaminen ja kvantitatiivinen analyysi biologisista näytteistä. Tällä hetkellä metabolomiikassa käytettyjä analyysitekniikoita ovat NMR, kromatografia ja massaspektrometria, joilla kullakin on omat rajoituksensa herkkyydessä, spesifisyydessä, kvantitoinnissa, soveltuvuudessa ja/tai analyysikapasiteetissa. Tämän tutkimuksen tavoitteena on kehittää erittäin herkkiä ja spesifisiä menetelmiä metaboliittien analysointiin biologisista näytteistä käyttäen mikrosirutekniikan keinoja. Tärkein tavoite on kehittää mikrosirupohjaisia erotustekniikoita, joilla voidaan nopeasti erottaa kaikki näytteessä olevat metaboliitit. Nämä erotussirut perustuvat kaksidimensionaalisiin erotuksiin, joissa käytetään erilaisia kromatografisia erotusmenetelmiä. Metaboliittien luotettavaa tunnistusta varten mikrosirujen pinnat muokataan sellaisiksi, että niiltä voidaan nopeasti ja suoraan analysoida eri metaboliitit massaspektrometrisesti. Lisäksi erotusmikrosirut liitetään massaspektrometriin jo olemassa olevien mikrosirupohjaisten ionilähteiden avulla, jolloin saadaan erittäin herkkä analyysimenetelmä. Näitä uusia tekniikoita ja menetelmiä tullaan käyttämään erilaisten lääkeaineiden metaboliakarttojen tekemiseen ja metaboliseen profilointiin. Niitä käytetään myös esim. kombinatoriaalisten kirjastojen nopeaan kartoitukseen sekä uusien lääkeainekandidaattien bioaktiivisuuden kartoitukseen.
Vastaava tutkija
Ketola Raimo, Helsingin yliopisto, Farmasian tiedekunta, Lääkkeen keksintä- ja kehitysteknologian keskus (DDTC) Hankkeen kesto 2006 - 2008
Asiasanat
metabolia, mikrosiruteknologia, massaspektrometria
Hankkeen vaihe: päättynyt
HUOM! Tämä tutkimushankekuvaus on tuotettu Hankehaaviin Helsingin yliopiston TUHTI-tutkimustietojärjestelmästä, jota ei enää ylläpidetä. Tarkista ajantaiset tutkimushanketiedot Helsingin yliopiston TUHAT-järjestelmästä.
|