Kompostoinnissa toimiva mikrobisto on aikaisemmin määritetty pääasiassa perinteisin menetelmin. Kuten muissa ympäristöissä näin saatu mikrobistosta on yvin vajavainen. Tässä projektissa määritetään mikrobisto madollisimman kattavasti käyttäen molekyylibiologista läestymistapaa. Toimivan ja uonosti toimivan kompostointiprosessin mikrobien ribosomaalista DNA:ta monistetaan, kloonataan ja sekvensoidaan. Uniikeista klooneista muodostetaan ns. DNA-siruja joiden avulla kompostinäytteistä ja muista ympäristönäytteistä mikrobiston määritys onnituu nopeasti.
Tulokset
Laaja kirjasto kompostoinnissa aktiivisista mikrobeista, sekä sienistä että bakteereista, on saatu kloonattua ja sekvensoitua. Suuri osa klooneista edustaa mikrobeja, joiden sekvensseja ei löydy kirjastoista. Sienisekvensseja käyttäen koeybridisaatiot ovat osoittautuneet toimivan. Bakteerien kodalla nämä kokeet suoritetaan kevään 2005 aikana.
Vastaava tutkija
Romantschuk Martin, Helsingin yliopisto, Ympäristöekologian laitos Yhteistyötahot
Helsingin yliopiston biotekologian instituutti
Hankkeen kesto 2003 - 2005
Asiasanat
kompostointi, mikrobisto, DNA-analyysi, DNA-siru
Hankkeen vaihe: päättynyt
HUOM! Tämä tutkimushankekuvaus on tuotettu Hankehaaviin Helsingin yliopiston TUHTI-tutkimustietojärjestelmästä, jota ei enää ylläpidetä. Tarkista ajantaiset tutkimushanketiedot Helsingin yliopiston TUHAT-järjestelmästä.
|