Syanobakteerit tuottavat useita biologisesti aktiivisia yhdisteitä esimerkiksi peptidejä. Syklisiä ja lineaarisia peptidejä syntetisoidaan ei-ribosomaalisten peptidisyntetaasien ja polyketidisyntaasien avulla, jotka ovat isoja itsenäisistä osista muodostuvia entsyymejä. Hankkeen tavoitteena on tutkia peptidien biosynteesiä Nodularia-kannassa, joka on eristetty Itämereltä. Tämä kanta tuottaa yhtä syklistä pentapeptidiä (nodulariinia), kahta syklistä heksapeptidiä (nodulapeptiinejä) ja neljää lineaarista tetrapeptidiä (spumigiinejä). Nodulariini inhiboi proteiinifosfataaseja ja spumigiini inhiboi seriiniproteaaseja. Hankkeessa sekvensoidaan peptidisyntetaaseja ja polyketisyntaaseja koodaavat geenit sekä inaktivoidaan näiden geenien toiminta tutkimuskannassa. Sekvenssitiedon avulla voidaan suunnitella alukkeita ja koettimia, joilla mahdolliset nodulariinin tuottajat voidaan havaita luonnonnäytteistä. Lisäksi tämä tieto mahdollistaisi geneettiset tutkimukset nodulariinin, joka on yleine n hepatotoksiini (maksamyrkky) Itämeren syanobakteerikukinoissa, sekä muiden peptidien tuottoon vaikuttavista kasvuolosuhteista. Tutkimukset saattavat paljastaa sen miksi syanobakteerit tuottavat toksiineja ja muita bioaktiivisia peptidejä.
Vastaava tutkija
Lehtimäki Jaana, Helsingin yliopisto, Soveltavan kemian ja mikrobiologian laitos Hankkeen kesto 2001 - 2003
Asiasanat
Syanobakteerit, Nodularia, peptidit, nodulariini, peptidisyntetaasit, polyketidisyntaasit
Hankkeen vaihe: päättynyt
HUOM! Tämä tutkimushankekuvaus on tuotettu Hankehaaviin Helsingin yliopiston TUHTI-tutkimustietojärjestelmästä, jota ei enää ylläpidetä. Tarkista ajantaiset tutkimushanketiedot Helsingin yliopiston TUHAT-järjestelmästä.
|